Šokolaadi säilivusaeg sõltub paljudest teguritest, näiteks šokolaadi tüübist (tume, piima- või valge), pakendi tüübist ja säilitustingimustest. Peamised arvesse võetavad tegurid on maitse, tekstuur ja välimus.

Šokolaadis on vee aktiivsus (tootes oleva vaba vee hulk, mis soodustab mikroobide kasvu toidus) madal ja jääb vahemikku 0,3–0,4.Seega on šokolaadis mikrobioloogilise kasvu oht väga madal. Ainult salmonella võib kakao koostisosades ja piimapulbris ohtu kujutada, mistõttu kontrollitakse Puratose iga saadetist enne tootmises kasutamist hoolikalt.

Tõeline tume šokolaad, mis on valmistatud kakaovõist, on väga pika säilivusajaga; kuivas, jahedas ja kuumuse ning päikesevalguse eest kaitstult säilitatuna võib see säilida aastaid. Kakaovõi on väga stabiilne rasv ja kui šokolaad on täielikult kristalliseerunud, peab see "õitsemisele" üsna hästi vastu. Lisaks aitavad kakaomassis sisalduvad flavonoidid oksüdeerumist vältida. Kui aga ilmub rasvakiht, muutub tume šokolaad visuaalselt vähem atraktiivseks. See välimuse muutus esineb sageli koos tekstuuri kõvenemise ja aeglasema sulamisega, mis on põhjustatud rasva kristalliseerumise muutustest. Pane tähele, et kuigi rasvakiht tundub ebameeldiv, saab šokolaadi siiski retseptides kasutada või sulatada ja uuesti tempereerida. Õigetes tingimustes säilitades on tumeda šokolaadi säilivusaeg 2 aastat.

Päris piimašokolaad, mis sisaldab ka piimakuivaineid ja piimarasva, ei säili nii kaua kui päris tume šokolaad. Siiski on sellel õigetes (jahedas ja kuivas) tingimustes säilitamisel pikk säilivusaeg. Peamine põhjus, miks piimašokolaadil on lühem säilivusaeg, on see, et piimarasv oksüdeerub ja rääsub kiiremini kui kakaovõi. Säilivusaeg on sel juhul 1 aasta.

Valge šokolaad koosneb suhkrust, piimakuivaintest, piimarasvast ja kakaovõist. Kuna selles puudub kakaomass ja seega ka looduslikud antioksüdandid, oksüdeerub ja rääsub valge šokolaad suhteliselt kergesti, eriti valguse käes. Sellel šokolaaditüübil on tumeda ja piimašokolaadiga võrreldes madalaim säilivusaeg. Säilivusaeg on 6 kuud.

Kuna valgus ja õhk põhjustavad šokolaadi oksüdeerumist, on hea pakendamine valguse, õhu ja niiskusega kokkupuute vältimiseks võtmetähtsusega.

Šokolaadi on kõige parem säilitada puhtas keskkonnas, eemal võõrastest lõhnadest, temperatuuril kuni 20 °C ja madala suhtelise õhuniiskuse juures (suhteline õhuniiskus maksimaalselt 60%).Liiga kõrge temperatuur võib põhjustada rasvade õitsemist, liigne õhuniiskus aga suhkrute õitsemist.